音乐教育系成立于2007年,招生方向为音乐学（师范）专业，是国家级一流本科专业建设点和硕士学位授权点。设有器乐教研室、声乐教研室、钢琴教研室、音乐理论教研室。现有教师48人，其中教授4人、副教授19人、讲师19人，外聘教师6人。硕士研究生导师17人、博士学历教师10人。现有在校本科生410人，在校研究生41人。
教学设施完善，现拥有琴房、音乐微格实训室、多功能音乐厅等70个现代化教学空间。核心课程包含乐理、合唱与指挥、校园舞蹈编排、声乐、钢琴、器乐、课本音乐剧编创与实践、歌曲伴奏编配与弹唱、音乐课程与教学论、音乐教育心理学等。
音乐学（师范）专业立足吉林，面向全国，培养政治立场坚定、自觉践行社会主义核心价值观，具有高尚师德情操、深厚教育情怀、先进教育理念、扎实音乐从教能力和良好美育素养，在中学或教育文化机构从事音乐教学、教研及班级管理等工作，组织与指导校园音乐文化活动，具有持续发展潜力，爱岗敬业、积极进取的中学音乐骨干教师。
近年来，音乐教育系全体师生在各级各类比赛中获奖626项。其中，在全国普通高等学校音乐教育专业本科学生基本功展示中获得学校团体奖、个人全能奖、个人单项奖共48项；教师获国家级、省级教科研奖项共计78项。成功举办“向美而行·育见未来”吉林艺术学院艺术教育学院2024年新年音乐会，排演《运河谣》《沂蒙山》《长征》《野火春风斗古城》《党的女儿》等大型民族歌剧，举办优秀学生音乐会、毕业生音乐会等百余场。